FEBS Letters
Volume 567, Issue 1 , Pages 49-54 , 1 June 2004

Circadian clocks and natural antisense RNA

Edited by Horst Feldmann

Received 12 April 2004 ,Accepted 19 April 2004.

References 

  1. Pittendrigh CS. Cold Spring Harb Symp. Quant. Biol. 1960;25:159–184
  2. Bunning E. The Physiological Clock. New York: Springer; 1973;
  3. Pittendrigh CS, Bruce VG, Rosenzweig NS, Rubin ML. Nature. 1959;184:169–170
  4. Bünning, E., Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. (1960) 25, pp. 1–9
  5. Saunders DS. Insect Clocks. New York: Pergamon Press; 1982;
  6. Liu Y, Tsinoremas NF, Johnson CH, Lebedeva NV, Golden SS, Ishiura M, et al. Genes Dev. 1995;15:1469–1478
  7. Nowrousian M, Duffield GE, Loros J, Dunlap JC. Genetics. 2003;164:923–933
  8. Harmer SL, et al.  Science. 2000;290:2110–2113
  9. Ceriani MF, Hogenesch JB, Yanovsky M, Panda S, Straume M, Kay SA. J. Neurosci. 2002;22:9305–9319
  10. Akhtar RA, et al.  Curr. Biol. 2002;12:540–550
  11. Duffield GE, Best JD, Meurers BH, Bittner A, Loros JJ, Dunlap JC. Curr. Biol. 2002;12:551–557
  12. Panda S, et al.  Cell. 2002;109:307–320
  13. Winfree, A.T. (1986) Scientific American Books Inc., New York
  14. Ouyang Y, Andersson CR, Kondo T, Golden SS, Johnson CH. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 1998;95:8660–8664
  15. Lincoln GA, Andersson H, Loudon A. J. Endocrinol. 2003;179:1–13
  16. Hayama R, Coupland G. Curr. Opin. Plant Biol. 2003;6:13–19
  17. Froy O, Gotter AL, Casselman AL, Reppert SM. Science. 2003;300:1303–1305
  18. Kramer G. Naturwissenschaften. 1950;37:188
  19. Dunlap JC. Cell. 1999;96:271–290
  20. Konopka RJ, Benzer S. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 1971;68:2112–2116
  21. Feldman JF, Hoyle MN. Genetics. 1973;75:605–613
  22. Millar AJ, Carre IA, Strayer CA, Chua NH, Kay SA. Science. 1995;267:1161–1163
  23. Heintzen C, Nater M, Apel K, Staiger D. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 1997;94:8515–8520
  24. Bargiello TA, Jackson FR, Young MW. Nature. 1984;312:752–754
  25. McClung CR, Fox BA, Dunlap JC. Nature. 1989;339:558–562
  26. Hardin PE, Hall JC, Rosbash M. Nature. 1990;343:536–540
  27. Aronson BD, Johnson KA, Loros JJ, Dunlap JC. Science. 1994;263:1578–1584
  28. Crosthwaite SK, Dunlap JC, Loros JJ. Science. 1997;276:763–769
  29. Ballario P, Vittorioso P, Magrelli A, Talora C, Cabibbo A, Macino G. EMBO J. 1996;15:1650–1657
  30. Linden H, Macino G. EMBO J. 1997;16:98–109
  31. Froehlich AC, Loros JJ, Dunlap JC. Proc. Natl Acad. Sci. U.S.A. 2003;100:5914–5919
  32. Cheng P, Yang Y, Wang L, He Q, Liu Y. J. Biol. Chem. 2003;278:3801–3808
  33. Antoch MP, et al.  Cell. 1997;89:655–667
  34. Allada R, White NE, So WV, Hall JC, Rosbash M. Cell. 1998;93:571–804
  35. Rutila JE, Suri V, Le M, So WV, Rosbash M, Hall JC. Cell. 1998;93:805–814
  36. Luo C, Loros JJ, Dunlap JC. EMBO J. 1998;17:1228–1235
  37. Harmer SL, Panda S, Kay SA. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 2001;17:215–253
  38. Cheng P, Yang Y, Liu Y. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2001;98:7408–7413
  39. Lee K, Dunlap JC, Loros JJ. Genetics. 2003;163:103–114
  40. Gorl M, Merrow M, Huttner B, Johnson J, Roenneberg T, Brunner M. EMBO J. 2001;20:7074–7084
  41. Yang Y, Cheng P, Liu Y. Genes Dev. 2002;16:994–1006
  42. Yang Y, Cheng P, Zhi G, Liu Y. J. Biol. Chem. 2001;276:41064–4106472
  43. Huang ZJ, Edery I, Rosbash M. Nature. 1993;364:259–262
  44. Loudon AS, Semikhodskii AG, Crosthwaite SK. Trends Genet. 2000;16:477–481
  45. Tei H, Okamura H, Shigeyoshi Y, Fukuhara C, Ozawa R, Hirose M, et al. Nature. 1997;389:512–516
  46. Shearman LP, Zylka MJ, Weaver DR, Kolakowski LF, Reppert SM. Neuron. 1997;19:1261–1269
  47. Takumi T, et al.  EMBO J. 1998;17:4753–4759
  48. Dunlap JC, Loros JJ, Liu Y, Crosthwaite SK. Genes Cells. 1999;4:1–10
  49. Russo VE. J. Photochem. Photobiol. B. 1988;2:59–65
  50. Heintzen C, Loros JJ, Dunlap JC. Cell. 2001;104:453–464
  51. Schwerdtfeger C, Linden H. EMBO J. 2003;22:4846–4855
  52. Devlin P. J. Exp. Bot. 2002;53:1535–1550
  53. Emery P, Stanewsky R, Hall JC, Rosbash M. Nature. 2000;404:456–457
  54. Krishnan B, Levine JD, Lynch MK, Dowse HB, Funes P, Hall JC, et al. Nature. 2001;411:313–317
  55. Rutter J, Reick M, Wu LC, McKnight SL. Science. 2001;293:510–514
  56. Kramer C, Loros JJ, Dunlap JC, Crosthwaite SK. Nature. 2003;421:948–952
  57. Dolfini S, Consonni G, Mereghetti M, Tonelli C. Mol. Gen. Genet. 1993;241:161–169
  58. Schmitz G, Theres K. Mol. Gen. Genet. 1992;233:269–277
  59. Eddy SR. Nat. Rev. Genet. 2001;2:919–929
  60. Szymanski M, Barciszewska MZ, Zywicki M, Barciszewski J. J. Appl. Genet. 2003;44:1–19
  61. Kumar M, Carmichael GG. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998;62:1415–1434
  62. Lehner B, Williams G, Campbell RD. Trends Genet. 2002;18:63–65
  63. Shendure J, Church GM. Genome Biol. 2002;3; RESEARCH0044
  64. Yelin R, et al.  Nat. Biotechnol. 2003;21:371–372
  65. MacIntosh GC, Wilkerson C, Green PJ. Plant Physiol. 2001;127
  66. Rosok O, Sioud M. Nat. Biotechnol. 2004;22:104–108
  67. Ambros V. Cell. 2001;107:823–826
  68. Lee RC, Feinbaum RL, Ambros V. Cell. 1993;75:843–854
  69. Moss EG, Lee RC, Ambros V. Cell. 1997;88:637–646
  70. Slack FJ, Basson M, Liu Z, Ambros V, Horvitz HR, Ruvkun G. Mol. Cell. 2000;5:659–669
  71. Hamilton AJ, Baulcombe DC. Science. 1999;950–952
  72. Bartel DP. Cell. 2004;116:281–297
  73. Sleutels F, Barlow DP. Curr. Opin. Genet. Dev. 2000;10:229–233
  74. Avner P, Heard E. Nat. Rev. Genet. 2001;2:59–67
  75. Carmichael G. Nat. Biotechnol. 2003;21
  76. Lazar MA, Hodin RA, Darling DS. Mol Cell Biol. 1989;9:1128–1136
  77. Preitner N, Damiola F, Lopez-Molina L, Zakany J, Duboule D, Albrecht U, et al. Cell. 2002;110:251–260
  78. Flamant F, Samarut J. Trends Endocrinol. Metab. 2003;14:85–90
  79. Katz D, Lazar MA. J. Biol. Chem. 1993;268:20904–20910
  80. Lazar MA, Hodin RA, Cardona G, Chin WW. J. Biol. Chem. 1990;265:12859–12863
  81. Hastings ML, Milcarek C, Martincic K, Peterson ML, Munroe SH. Nucleic Acids Res. 1997;25:4296–4300
  82. Onishi H, et al.  J. Neurosci. Res. 2002;68:551–557
  83. Sauman I, Reppert SM. Neuron. 1996;17:889–900
  84. Gotter AL, Levine JD, Reppert SM. Neuron. 1999;24:953–965
  85. Korneev SA, Park JH, O'Shea M. J. Neurosci. 1999;19:7711–7720
  86. Zhou BS, Beidler DR, Cheng YC. Cancer Res. 1992;52:4280–4285
  87. Crosthwaite SK, Loros JJ, Dunlap JC. Cell. 1995;81:1003–1012
  88. Hastings MH, Reddy AB, Maywood ES. Nat. Rev. Neurosci. 2003;4:649–661

PII: S0014-5793(04)00549-6

doi: 10.1016/j.febslet.2004.04.073

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Volume 567, Issue 1 , Pages 49-54 , 1 June 2004